吉田海運グループは、2023年10月1日より施行される「適格請求書等保存方式（インボイス制度）」について適格請求書発行事業者として登録申請済みであり、お客様に対するご請求に際してはすべてインボイス制度の要件に準拠した適格請求書を発行いたします。
吉田海運グループ各社の登録番号は以下のとおりです。
| 社名 | 登録番号 |
| 吉田海運株式会社 | T4310001006143 |
| 吉田海運ロジソリューションズ株式会社 | T1310005003998 |
| 株式会社南栄運輸 | T8340001003027 |
| マルコウ輸送株式会社 | T4310001009105 |
| 株式会社ワイエフエフ | T8250001006724 |
| 株式会社ウィズ | T7010101008182 |
| 佐世保配車センターAUTOWAORKS株式会社 | T9310001005909 |
| 吉田重機工業株式会社 | T7310001005869 |
| 株式会社パシフィックベースン | T8310001016246 |
| 株式会社九州アグリコール太良 | T5300001010517 |
| 株式会社カネタ | T5300001005038 |
| 株式会社鎮西商事 | T2310001009577 |
| 西日本産業交流事業協同組合（※） | T8310005007860 |
